动画主要讲述的是王志哲是电脑权威王博士之子。一天晚上，他和老爸誓要“爆机”，而妈妈如往常一样对这这对无所事事的父子大发雷霆。这时，王博士大学时的好友达克浑身是血登门拜访。正在全家人诧异时，闯进来一只紫色狼人！达克也化身成蓝色狼人，并打败了紫色狼人。 　　王博士夫妇和达克去研究所小哲把达克留下的色纸和《折纸宝典》拿到了学校同自己的好友“书呆子”和小莲一起折纸同时由于知道了折纸战士的秘密他们被“黑色联盟”追杀，阴错阳差地三人都化身为折纸战士。然而，与黑色联盟的战斗才仅仅开始………而随之而来的，还有解开地球历史迷雾的折纸战士来历之谜，以及无所不能的神………